Pramení jihozápadně od Čáslavi u obce Dobrovítov v nadm. výšce 500m pod názvem Jánský potok. Nejprve teče k severu, u Čáslavi se stáčí na severozápad a tento směr si udržuje až k svému ústí. Ústí zleva do starého labského ramene v ř.km 88,8 pod Starým Kolínem. Plocha povodí měří 346 km2, délka sjížděného toku je 17 km.

Klejnárka je říčka místního významu. Rychle proudí v polích a loukách od Čáslavi ke Kolínu. Břehy jsou jen částečně regulovány, koryto hlinité. Plavba je nenáročná a přehledná, jen místy ji ztěžují padlé stromy nebo zarostlé řečiště. Říčku mohou sjíždět i méně zkušení vodáci - na otevřených lodích.