Pramení v Jiřínské pahorkatině na sobotecku, odkud teče k jihozápadu a u Nymburka se vlévá z pravé strany do Labe na ř.km 59,0. Plocha povodí měří 630 km2. Délka sjížděného toku činí více než 20 km.

Řeka je místího významu. Na svém horním toku má sice zajímavé okolí, ale je zde téměř nesjízná. Pod Rožďálovice vstupuje do Mrlinské tabule, protéká lukami a poli a většinou je regulována. Koryto je písčité a hlinité. Voda bývá velmi často znečišťována hospodářskými a zemědělskými odpady, zvláště na podzim. V tomto období nelze jízdu po Mrlině doporučit. Řeka má velmi mírný tok, který mohou sjíždět i začínající vodáci na otevřených lodích.